AWS unterhält mehrere Zertifizierungen für den Schutz seiner Rechenzentren. Diese Zertifizierungen betreffen die physische und umgebungsbezogene Sicherheit, die Systemverfügbarkeit, den Netzwerk- und IP-Backbone-Zugang, die Kundenbereitstellung und das Problemmanagement. Der Zugang zu den Rechenzentren ist auf autorisiertes Personal beschränkt, das durch biometrische Identitätsüberprüfungsmaßnahmen überprüft wird. Zu den physischen Sicherheitsmaßnahmen gehören: Sicherheitspersonal vor Ort, Videoüberwachung, Fallen und zusätzliche Maßnahmen zum Schutz vor Eindringlingen.